上海市农委人士说，上海将就上述举措及时告知相关省份畜牧兽医主管部门，上海暂时停止活禽交易、暂时关闭所有活禽交易市场。上海市动物卫生监督部门将会同上海市公安局、市建设交通委等部门加强指定市境公路道口执法检查，按照上海市政府通告要求进行劝退，严格禁止外来活禽进入上海。相关区县也将切实加强非指定道口的管理，加强巡查值班，严禁外来活禽进入上海。
上海正进一步部署防控H7N9禽流感的措施，对凡检测出有病毒或H7呈阳性的禽类，按动物疫病防控要求进行扑杀，对扑杀的禽鸟、禽鸟类排泄物、被污染饲料、垫料以及污水等进行无害化处理。上海市动物无害化处理中心安排专门力量，优先对送来的扑杀禽类等进行焚烧处理，并做好登记。对病毒核酸检测呈阴性的，原则上由家禽屠宰企业统一收购、屠宰，经检疫合格后上市。 5日，上海沪淮农副产品批发市场共扑杀家禽20536羽，已全部送上海市动物无害化处理中心进行焚烧处理。
此外，在全市暂停活禽交易、暂时关闭所有活禽交易市场后，将指导做好活禽批发交易市场的消毒，指导区县有关部门做好关闭活禽零售市场的消毒。强化面上动物H7N9禽流感监测，会同相关部门和区县，扩大检测范围，增加监测的数量和频次，重点加强对上海禽类养殖密集区、候鸟栖息地等高风险区域的监测。各级动物疫病预防机构做好监测的各项准备和试剂储备。
根据上海市政府通告，上海从4月6日起对全市3大活禽批发市场和461家活禽零售点以及各类花鸟市场，暂停活禽、野生鸟类的交易活动，并对所有活禽交易市场进行清理、消毒和封闭管理，坚决取缔各类马路市场活禽交易行为。暂时封闭公园等的进入式鸟园、鸽场等场所，暂停鸟类表演等活动。
